倚天剑之所以在武当放着，主要得益于张三丰的智谋与胆识。张三丰适时出手教训了灭绝师太，并巧妙地将倚天剑留在了武当。灭绝师太明白张三丰的用意，因此并未激烈反抗。
武当作为张三丰的所在地，他已是武林神话般的存在，即使拥有倚天剑，也无人敢轻易挑战。
因此，倚天剑在武当存放，不仅保证了剑的安全，也避免了峨眉派因剑而招致的祸患。
张三丰此举，看似是对峨眉的压制，实则是对峨眉的庇护，使得峨眉派得以安心发展多年。
《倚天屠龙记》中，倚天剑一直在峨眉派。
峨眉派是郭襄在寻找杨过20年未果后创建的门派，郭襄是峨眉派开山祖师，而倚天剑是郭襄所有，所以一直留在峨眉派，后被灭绝师太继承。后来赵敏给峨眉派所有人吃了十香软筋散，把她们囚禁在万安寺中，倚天剑就被赵敏夺走。
周芷若为了履行师父灭绝师太的承诺，偷了倚天剑和屠龙刀，嫁祸给了赵敏，还把张无忌的表妹殷离给杀害了，谢逊也没能逃过她的毒手。
不过结局却出人意料。殷离并没有死，反倒治好了练千蛛万毒手时留下的毒伤，谢逊了却了一切恩怨，立地成佛。屠龙刀也重新回到张无忌的手里。一切好像没发生一样，周芷若和张无忌也和好如初。只是此时的张无忌心已经属于赵敏。