不会。
应征公民体检初检、复检没有通过的，依据征兵工作规定，是不会留案底的，体检报告留存在地方社区、乡镇武装部期限为半年，以备入伍公民到达部队再体检是不合格退兵时对照。
在征兵体检过程中，下蹲检查时膝盖有响声并不会直接影响到报名士兵的评定，但同时也暗示着该士兵可能存在膝关节问题或缺乏足够的锻炼。在接下来的身体检查过程中，医生会根据具体情况进一步检查排除或确诊膝关节问题。
因此，在参加征兵体检前，报名士兵应该注意保持良好的体态、健康饮食和适当的锻炼，以减少可能出现的膝关节问题。
是的，征兵体检不合格，就是不能当兵的，这个是部队的硬性规定，成为一名合格的军人，首先需要有一个适合服役的身体素质