普罗米修斯遭受的两种痛苦是：

1.被火神锁在悬崖上，日夜遭受风吹雨淋的痛苦，普罗米修斯不屈服；

2.宙斯又派凶恶的鹫鹰啄食普罗米修斯的肝脏，让他的肝脏被日食夜长。