九九版有假钞。
因为九九版纸币已经流通了很长时间，使用频率较高，加上技术手段的发展，制造假钞的成本已经大大降低，各种类型的假钞也越来越难以辨别。
除了检查钞票上的安全线、水印、光彩光变油墨等特征外，还可以使用专业的验钞仪进行识别。
同时也要提高公众对假钞的识别能力和防范意识，保护个人和社会的财产安全。
有
1、1999版百元钞采用了横竖双号码，横号为黑色，竖号为蓝色。
2、1999版百元钞中的安全线，迎光观察可见RMB100微小文字，仪器检测有磁性。
3、正面毛泽东头像、中国人民银行行名、盲文及背面人民大会堂等均采用雕刻凹版印刷，用手指触摸有明显凹凸感。
4、看油墨真币左下方用的光变油墨倾斜一定角度能变成蓝色，而假币则没有。
5、找水印和图案透光观察，正面有古钱币图案，但1999版和2005版的位置不同。真币正面左侧均有立体感很强的水印。假币的水印比较模糊，不具立体感。