东莞东站同常平东站的区别主要有：

1.东莞东站是东莞火车东站，原来叫常平东站，京九线和广梅汕铁路经过；

2.东莞站是东莞火车站，即原来的常平站，广九线经过，与常平汽车总站相邻相对；

3.东莞东站即为东莞市汽车东站、市汽车东站，位于寮步镇横坑；东莞市汽车总站位于万江汽车总站。