邻居建房协议书需要明确标明合作意向、建设内容、共同承担的责任、工程进度和质量标准等条款。双方需签字、盖章、留底，保证协议书的真实性和完整性。并在未来的建设过程中时刻注意协议的遵守，确保其具有法律效力。