灵活就业人员在海南生孩子可以报销医保，但需要满足一定的条件。首先，灵活就业人员需要缴纳基本医疗保险，住院报销的需要超过自付的起付线，不同医疗机构不同报销范围。其次，如果灵活就业人员生育时参保身份为退休职工、灵活就业人员、未就业配偶的，也可以享受生育医疗费用待遇。

关于生育津贴的申领，可以通过线上或线下的方式进行。线上申领需要单位的人事工作人员登录海南医保服务平台，按里面的指引办理申领手续。线下申领需要填写《海南省城镇从业人员生育津贴申请表》1份，加盖单位公章，到就近的医保经办机构服务柜台申领。

需要注意的是，如果从业人员未就业配偶已参加城镇从业人员基本医疗保险或者城乡居民基本医疗保险并享受相关待遇的，不再享受生育医疗费用待遇。此外，如果生育女职工已经领取了产假内的工资，而生育津贴的标准高于产假内工资的部分，单位应当将差额补发给生育女职工。