如果客户在农村信用社的定期存款单丢失了，可以通过以下方式查询：

最直接的方式为客户持本人身份证原件，到当地任一一家农村信用社营业网点柜台查询。

查询后，如确实已经丢失，可以直接办理定期存单挂失补开。

补开后的存单存款日等信息与原存款单日期一致，原存款单直接作废。