由医疗机构自行承担。根据巜咸阳市新型农村合作医疗单病种付费管理为法（20l7版）》的通知：实行单病种付费打包制管理，也就是说单病种患者只需交纳规定费用后，其余部分全由医疗机构承担。这是为了防止医疗机构过度医疗，变向增加患者负担。