地铁S3号线途经江宁区、雨花台区、建邺区和浦口区，线路东起南部新城的南京南站，一路向西经过雨花经济开发区北部、铁心桥地区、河西新城南部，行驶大胜关长江大桥专用过江通道跨越长江，进入桥林新城，西至高家冲站，是中国唯一一条在桥上与高铁并行的地铁线路。
截止2021年8月7日，南京地铁S3线路并未被官方宣布停运。S3线路是南京地铁西北-东南向的城市轨道交通线路，共设有17个站点，覆盖了南京市江宁区、秦淮区、建邺区、鼓楼区以及雨花台区等多个区域，为市民出行提供了便利。但是，由于个别原因（如维修、故障、恶劣天气等），地铁S3线可能会在特定时间段内进行停运或调整，请市民关注官方通告或实时动态信息。