有区别。

业务范围上，长江海事局负责长江干线水域的水上交通安全监管。湖北海事局负责长江支流水域、湖北省行政区内其他内河通航水域的水上交通安全监管。

行政上，长江海事局由交通运输部长江航务管理局管理。湖北海事局由省交通运输厅管理。

机构属性方面，长江海事局是行政机关。湖北海事局是事业单位。