Protel99SE对系统有要求，一直以来是基于WindowsXP系统。
2000年开发的Protel99SE，暂时不支持Windows7操作系统。
Protel99SE是应用于Windows9X或2000或NT操作系统下的EDA设计软件，采用设计库管理模式，可以进行联网设计，具有很强的数据交换能力和开放性及3D模拟功能，是一个32位的设计软件，可以完成电路原理图设计，印制电路板设计和可编程逻辑器件设计等工作，可以设计32个信号层，16个电源地层和16个机加工层。
windows7打开软件时的弹窗是系统自带的安全保护模式，用于防止后台软件自动运行；具体关闭的操作如下：
1.打开控制面板，点击用户帐户和家庭安全选项。
2.进入如图的界面，点击用户账户选项。
3.点击更改用户帐户控制。
4.在弹出的设置窗口中，根据如图的界面选择正确的选项。
5.除了以上的方法，也可以通过命令进行执行；打开命令窗口输入如图的命令指令。
6.执行完成后回车确定。