云南小公司给员工缴纳社保的大致流程如下：

1. 登记成为社保缴纳单位：公司需到当地社保管理部门进行登记，获取社保缴纳单位代码，并进行备案登记。

2. 办理员工入职手续：公司需要按照规定，办理员工的入职手续，包括签订合同、办理员工档案等。

3. 缴纳社保费用：公司需要按照员工工资总额的一定比例，向当地社保管理部门缴纳社保费用。社保费包括养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险和生育保险。

4. 员工扣款并缴纳个人社保费用：公司需要从员工的工资中扣除个人社保费用，并按照规定向社保管理部门缴纳。

5. 报送社保信息：公司需要按照规定，将员工的社保信息报送给社保管理部门，包括员工的个人信息、职工工资、社保缴纳情况等。

6. 定期报告和缴纳：按照规定的时间周期，公司需要定期向社保管理部门报告员工社保信息，并缴纳员工的社保费用。

需要注意的是，具体的流程和要求可能会因地区和具体政策而有所不同，建议公司在操作过程中咨询当地社保管理部门进行指导。此外，公司在缴纳社保时也需要关注最新的社保政策和费率变化，及时进行相应调整。