要调校斯柯达明锐发动机，首先需要找到专业的机械师，并在专业的汽车修理厂进行调校。通常，发动机调校包括对点火系统、燃油混合比、气门正时、油门响应等方面进行调整。
在调试过程中，需要使用专业的测试设备和仪器，以确保发动机的性能和可靠性。同时，需要注意的是，任何个人对发动机进行调整可能会导致损坏发动机甚至导致事故发生，因此切勿私自进行调校。
如果斯柯达明锐的发动机在行驶时能够正常输出动力并不影响行驶安全，那么暂时可以继续开。但是，这种哒哒响声可能暗示着发动机部分组件的磨损或老化，请及时检查并进行维修更换以避免发生安全事故。此外，避免长时间高速行驶以增加安全性，如果条件允许，尽快进行检修以保障车辆长期使用。