区别是科创板员上交所代码688开头的股票，而创业板是深交所代码30开头的股票。科创板和创业板都是上市前五天不设涨跌幅限制，五日后涨跌幅为20%。创业板于2009年10月30日正式在深交所上市，而科创板于2019年7月22日在上海交易所上市。
据《上海证券交易所科创板股票交易特别规定》，当科创板股票日收盘价格涨跌幅达到±15%、或日价格振幅达到30%、或日换手率达到30%时，上交所会公布当日买入、卖出金额最大的5家会员营业部的名称及其买入、卖出金额。
此外，在科创板股票连续3个交易日内日收盘价格涨跌幅偏离值累计达到±30%时，上交所也会披露该股票交易异常波动期间累计买入、累计卖出金额最大的5家会员营业部的名称及其买入、卖出金额。
科创板的股票，是上海交易所的股票，其代码开头三个数字是“688”。而创业板是深圳市场股票，其代码前三位通常是“300”或“301”。那么，这两者的代码上的一个重大区别，就是科创个股以6开头，创业个股以3开头。
目前创业板和科创板都实行注册制，它们新股上市前5个交易日不设涨跌幅限制，5个交易日后涨跌幅限制为20%，有盘后定价交易。
“创业板”又称二板市场即第二股票交易市场，是与主板市场不同的一类证券市场，专为暂时无法在主板市场（包括主板和中小企业板）上市的创业型企业提供融资途径和成长空间的证券交易市场。
“科创板”是独立于现有主板市场的新设板块，并在该板块内进行注册制试点。