1、如果农村自建房超平，则需要进行合法化处理才能办理房产证。
2、农村自建房属于违章建筑，需要进行合法化处理，包括申请规划建设、竣工验收等手续。
3、如果房屋符合规划建设标准，经过竣工验收，并且在土地使用权、房屋所有权等方面的手续齐备，就可以办理房产证了。
4、需要注意的是，如果房屋不符合规划建设标准或者土地使用权、房屋所有权等方面的手续不齐备，就无法办理房产证。
此时，需要根据实际情况进行合法化处理。
1. 首先要取得建设用地的权属证明，一般是农村土地承包经营权证书或农村宅基地使用权证书，如果没有这个证明，需要先去当地土地管理部门进行申请。
2. 建设项目的规划设计和施工图应经过审查批准，并经过验收合格，属于合法建筑。
3. 对未经许可擅自占地、未批先建的房屋，需要进行登记备案并符合相关的规定。
4. 提交相应的房产证申请材料，包括建筑规划许可证、建房验收合格证明、用地证明等。
5. 缴纳相关的费用，比如土地使用费、房产证办理费等。
6. 最后进行审核并核发房产证。
如果农村自建房地面面积大于国家规定的限制，就不能办理房产证，这是法律规定。如果地面面积没有超出限制，就可以向当地房管部门申请办理房产证。但需要注意的是，农村自建房的房产证仅能是“农村房屋所有权证”，不能是“商品房房产证”，且办理过程相对较为繁琐，需要先办理规划许可证、施工许可证、竣工验收等手续，满足相关条件后方可办理。
此外，如果该自建房是将村集体土地上的住宅用于个人或家庭居住，还需要取得村委会或乡镇政府的同意。