1.酸法水解，以浓度为百分之20的盐酸煮沸回流16小时到20小时，可将蛋白质水解成氨基酸；
2.碱法水解，用6摩尔每升氢氧化钠或4摩尔每升氢氧化钡，煮沸6小时即可完全水解得到氨基酸；
3.蛋白酶法水解，常温和酸碱度在2到8时，氨基酸完全水解。
蛋白质水解分2种，即完全水解和不完全水解。
蛋白质完全水解只产生氨基酸，不完全水解会产生多肽。
氨基酸水解断的是肽键，因为蛋白质分子中各种氨基酸的连接方式形成肽键和排列顺序是蛋白质的一级结构；多肽链卷曲盘旋和折叠的空间结构、称为蛋白质的二级结构，所以断的是一级结构。
蛋白质水解先消耗能量，后产生能量。
蛋白质水解会生成氨基酸，是蛋白质水解酶来使之分解的，通常这不需要提供其他的能量，只要是适宜的温度下就自发进行。
氨基酸的缩合是放热的，蛋白质的水解就需要吸热。
所以，蛋白质水解应该是消耗能量的，但是由于蛋白质水解酶这种生物催化剂又使得消耗的能量很少。
而释放能量则是利用蛋白质的水解产物时候会发生的。