包工头拖欠3000元可以立案，但实际情况比法律规定要复杂。第一、包工头拖欠多少人的工资以及拖欠工资总额。如果仅拖欠一个人工资3000元，立案的可能性不大。

第二、拖欠工资时间，包工头拖欠农民工工资时间越长，拖欠工资越多，立案的可能性越大。

第三、也是最重要的因素，即包工头的实际情况，如果包工头有钱不支付，性质就变了，公安机关必须立案。