深圳医学科学院是深圳市政府批准成立的一所研究型医科院校，属于事业单位。主要功能是开展医学科学研究和人才培养，推动深圳医学和生命科学的发展。
深圳医学科学院将与深圳大学医学院、南方科技大学医学院一起，形成“三位一体”的格局，打造粤港澳大湾区医学教育和科技创新高地。
深圳医学科学院和深圳大学医学院是两个不同的机构。深圳医学科学院是由深圳市政府设立的，其性质为市政府举办的事业单位，实行党委领导下的院长负责制。该机构不定编制、不定级别，并实行社会化用人制度。
而深圳大学医学院则是深圳大学的一个二级学院，于2007年经深圳市人民政府批准成立。为了促进交叉学科的发展，原在深大信息工程学院的生物医学工程系也转入了医学院。
深圳医学科学院（Shenzhen Medical Academy of Research and Translation，简称深圳医学科学院（Shenzhen Medical Academy of Research and Translation，简称SMART）是一所新型的研究型医疗机构，其重要使命包括探索鼓励源头创新的新机制、引进与培养高水平人才。该机构致力于开展覆盖生物医学基础研究、临床研究和产业转化的全链条研究及转化工作，以促进人民生命健康的发展 。
具体而言，深圳医学科学院重点聚焦重大疾病防治、国际前沿医疗技术以及可持续发展健康研究领域。在这些领域，该机构主要进行应用基础研究、临床及转化研究、公共卫生研究，旨在推动研究转化、工程化及产业化全链条创新。
与传统的医科院相比，深圳市医科院不仅仅是一个单纯的研究机构，它还承担着政府赋予的重要职能。其中包括科技资源管理、医学科学研究、教育与交流、临床研究与成果转化以及政策咨询等方面的工作 。