由于念青唐古拉峰地处大陆腹地，山脉的屏障作用阻挡了西北的寒流和印度洋的暖流，基本属于半干旱大陆性气候，年降水量在300-400毫米之间。每年五月中旬至九月中旬是该地区雨季