有区别，区别在于，夫子庙为纪念孔子修建的，报恩寺是佛寺
夫子庙：是南京一处为了纪念供奉伟大的思想家孔子而修建的庙宇，是南京十大风景名胜排行之一，这座夫子庙的位置位于南京市秦淮区秦淮河的北岸贡院街，就在江南贡院的西边，夫子庙是我国的第一座最高学府，意义很深刻。
大报恩寺遗址公园位于江苏省南京市秦淮区中华门外，是中国规格最高、规模最大、保存最完整的寺庙遗址，遗址公园中保护性展示了大报恩寺遗址中的千年地宫和珍贵画廊，以及从地宫中出土的石函、铁函、七宝阿育王塔、金棺银椁等世界级国宝，是夫子庙秦淮风光带重要组成部分。
夫子庙—秦淮风光带景区是中国农历春节期间最具有年味的地方之一，每年1月下旬左右开始持续到3月，景区都会举办一年一度的秦淮灯会，主要集中在每年春节至元宵节期间举行。有着“秦淮灯彩甲天下”美称的秦淮灯会期间，秦淮河两岸张灯结彩，无色灯光倒映在河水之中，流光溢彩，美不胜收。夫子庙灯会是流传于南京地区的民俗文化活动，是一个集灯展、灯会和灯市为一体的大型综合型灯会。春节期间还有祈五福、编平安绳、捶丸、蹴鞠等民俗节日体验
12月25日开始开放。大报恩寺位于南京市秦淮区中华门外，是中国历史上最为悠久的佛教寺庙，其前身是东吴赤乌年间（238─250年）建造的建初寺及阿育王塔，是继洛阳白马寺之后中国的第二座寺庙，也是中国南方建立的第一座佛寺，中国的佛教中心，与灵谷寺、天界寺并称为金陵三大寺，下辖百寺。