根据我所了解的法律法规，幼儿园不接种疫苗不让入园是合法的。因为幼儿园作为教育机构，应该保障每个孩子的健康和安全。疫苗接种是预防接种的重要方式之一，可以有效防止一些严重传染病在幼儿园内传播。
另外，国家已经发布了疫苗接种法律法规，明确规定未按照规定接种疫苗的，不得进入教育机构就读。因此，幼儿园不接种疫苗不让入园是合法的，也是保障每个孩子健康的必要措施。
幼儿园不上大班对小学申请并没有直接影响。小学入学的重要考虑因素是孩子的智力水平、学习能力和个人品质。
不过，如果孩子在幼儿园阶段缺乏与其他孩子的社交经验，可能会影响其适应新环境和与同龄人交流的能力，因此应该注重在幼儿园阶段培养孩子的社交能力和独立自理能力。