当温度偏高的时候，比如温度在30～33℃时，绝大部分孵化出壳的稚龟呈雌性；当温度偏低时，比如温度23～27℃时，绝大部分孵化出壳的稚龟呈雄性。
首先，巴西龟的公龟前爪会稍微长一些，而母龟则会稍短。
其次，也可以通过判断尾巴来分辨，巴西龟的公龟尾巴更粗，比较长。母龟的尾巴则很细，而且相对较短。
此外，也可以通过巴西龟的体重和花纹来进行分辨，巴西龟的母龟成熟后体重一般会在五百克以下，而且腹部的花纹比较稀疏。
一般情况下经过50～65天的孵化，稚龟将破壳而出。在孵化过程中，将采回龟卵放在高25厘米的木箱中，箱底钻若干个小孔，底铺15—20厘米的砂或水苔，将龟排在砂中或水苔中，再向卵上撒放2厘米左右厚的细纱或水苔，砂上盖湿毛巾，保持室内湿度25—35度。