不经过民乐县，红旗河经过张掖市的肃南县皇城区及山丹军马场，还有甘州区，临泽县和高台县。
红旗河经过甘肃临夏市、临夏县、永靖县、广河县、和政县、康乐县等等。红旗河工程从甘肃岷江进入甘肃，通渭河，沿河西走廊贯穿大半个甘肃，是先从雅鲁藏布江出发，进入怒江，再借助隧洞进入澜沧江，然后是金沙江、雅砻江、大渡河、岷江、渭河、大渡河，河西走廊，最后进入新疆，最远能延伸到吐哈盆地、和田。
红旗河，不经过乌海，但是有一条河经过乌海，也是中国有名的一条河，它富裕了宁夏回族自治区，它经过乌海、磴口、临河、五原、前旗、包头很多很多地方，那就是内蒙古最有名的黄河。
红旗河从刘家峡水库经过黄河，沿祁连山向西经过武威，金昌，张掖山丹县，甘州区，临泽县，高台县，酒泉市，敦煌，后流入新疆自治区。