革兰氏阴性菌是由病原菌科的一些菌株引起的，包括大型杆菌（如肺炎球菌、呼吸道克雷伯菌和绿脓杆菌）、中等大型杆菌（如链球菌和衣原体菌）以及小细菌（如支气管变形杆菌和细菌性嗜酸杆菌）所形成的未加工聚集物。