因为吕不韦威望较高，威胁到了秦王嬴政对王朝的统治力。
吕不韦是人类历史上第一个伟大的风险投资家，正是在他的资产的支持和运作下，当时最强大的秦国进行了权力重组，而通过以秦政权为抵押进行资本运作，吕不韦自己成了真正的"无冕之王",这也威胁到了嬴政的统治。
为了巩固政权，所以嬴政下令消灭了吕不韦集团。
吕不韦玷污了赵太后乃至嬴政的名声，在嬴政未出生的时候，吕不韦将赵姬献给了子楚，在嬴政出生后，众多诸侯就在传闻吕不韦是嬴政的亲生父亲；吕不韦的权势危害到嬴政的君权，辅佐两代君主的吕不韦，早已在政治势力上形成一个庞大的集团，而这个政治集团，让多疑的嬴政加重了对吕不韦的野心的猜忌；吕不韦与嬴政不同的政治主张，导致秦始皇和吕不韦分道扬镳，吕不韦在《吕氏春秋》中推崇儒家的以德为本，而嬴政推崇法学，实行的就是商鞅变法时期确立的霸王之道，政治主张的不同间接的造成了嬴政不得不杀吕不韦的局面。
这个问题是由于司马迁的史书造成的,他写的史书里有两个版本,最近看的百家讲坛中,讲师着重是认为是邑人的儿子,因史书中记的是赵政是满月出生的,那根据现在的医学,不可能赵姬能怀着小孩嫁给邑人还满月出生,一般超过十个月的是死胎。
所以就有了嬴政是吕不韦的儿子的这种说法。