分子有些是由原子组成，有些是单一的．原子里还有原子核，夸克却属于原子核．夸克是1962年盖尔曼提出的应该是最小的了，但它不能直接组成物质．原子、分子这些又由质子、中子（H没有中子）、电子，构成至上世纪以来，物理学家们陆续发现了许多的粒子以及粒子间的作用力。
现在物理学家们认为物质粒子共有六种夸克和三种轻子；物质粒子间的作用力有四种：电磁力、万有引力、强相互作用力和弱相互作用力。
无论是核裂变还是核聚变，都会产生大量的中子、中微子和伽马光子这就是说，物质中包含有中子、中微子和伽马光子。
我们知道，中微子是一种神秘的宇宙粒子，具有不可思议的极强的穿透能力，能够自由地穿过墙壁、山脉、甚至地球与其他行星。
组成物质的基本成分是元素。
元素：化学元素就是具有相同的核电荷数的一类原子的总称。
化学元素，指自然界中一百多种基本的金属和非金属物质，它们只由一种原子组成，其原子中的每一核子具有同样数量的质子，用一般的化学方法不能使之分解，并且能构成一切物质。
一些常见元素的例子有氢，氮和碳。
到2012年为止，总共有118种元素被发现，其中94种是存在于地球上。
拥有原子序数大于83都是不稳定，并会进行放射衰变。
第43和第61种元素没有稳定的同位素，会进行衰变。
可是，即使是原子序数高达95，没有稳定原子核的元素都一样能在自然中找到，这就是铀和钍的自然衰。
分子是物质中能够独立存在的相对稳定并保持该物质物理化学特性的最小单元。
分子由原子构成，原子通过一定的作用力，以一定的次序和排列方式结合成分子。
以水分子为例，将水不断分离下去，直至不破坏水的特性，这时出现的最小单元是由两个氢原子和一个氧原子构成的一个水分子。
一个水分子可用电解法或其他方法再分为两个氢原子和一个氧原子，但这时水分子的特性已和水完全不同了。
有的分子只由一个原子构成，称单原子分子，如氦和氩等分子属此类，这种单原子分子既是原子又是分子。