果汁灌装有热灌装，冷灌装，无菌灌装，因为热灌装的温度比较高，所以对瓶子的耐性有一定的要求。
不同物料，所选择的灌装设备是完全不同的。
由于酒水、饮料行业的特殊卫生要求。
因此所选灌装机在结构上直接接触物料的部件应便于装拆和清洗，不允许有死角。
而且要有可靠的密封措施，严防杂物混入和物料散失。
例如对于芳香较浓的酒液，为避免挥发性芳香物质受到损失，一般应采用容杯式或常压灌装机；对于果汁类料液，为了减少与空气接触，保证产品质量，一般应采用真空加汁类灌装机 。
保质期如果在半年以内可以考虑巴氏杀菌方式，保质期长的话，用回转式灭菌锅可以加快热穿透缩短杀菌时间也能达到杀菌要求，同时对营养损失做到最小，口感保持最初的口味。
果汁常用的杀菌方法：
1.过滤冷除菌法；
2.热杀菌法及巴氏杀菌法；
3.深层膜无菌过滤法；
4.紫外线灭菌法；
5.高温煮沸法。
果汁饮料的原料中难免会存在腐烂的水果，这是不可避免的，因为工业生产的时候每天要处理上吨的原料，这些原料在运输和采收的过程中有些就会变质，而流水线生产的速度很快，所以不可能将它们捡出来，象有些软质水果，如：草莓、等，卸货时的腐烂率可能会很大，所以根本捡不完，不过在生产中，这些原料都会经过100度以上的高温处理，像闪蒸等，不管是什么都给杀死了，所以根本不用担心。
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