1.民办三本由于属于民办学校，学费和普通大学相比更高，进入大学进行深造的成本更高。
在目前的中国，三本大学大多数属于民办大学；
2.三本大学的社会认可度远低于一本和二本大学，学生的学习态度和进取心也弱于一本和二本大学的学生；
3.民办三本的学校基础设施，如图书馆，实验室等一般和普通大学等级相当；
4.三本的全称是本科第三批次，是指中国本科层次录取批次和录取顺序排在第三位置的高校。
三本院校的招生根据参加全国统一高考录取的方式进行，学制为四年，毕业证书和学位证书都是普通高等学校教育证书，录取院校一般为独立学院和民办高校。
"独立学院"强一些,因为"独立学院"办学起点高,导师基本上都是一本和二本高校的,教学质量有保障。
1、全日制本科高校等于1本高校等于2本高校等于3本高校等于相同的“本科学历和文凭”的高校；2、全日制本科高校等于“公立本科高校”等于“民办本科高校”等于相同的“本科学历和文凭”的高校；3、全日制普通本科高校等于普通1本高校等于普通2本高校等于普通3本高校等于相同水平的“普通本科学历和文凭”的高校；4、全日制普通本科高校等于普通公立本科高校等于普通民办本科高校等于相同水平的“普通本科学历和文凭”的高校。
民办三本毕业证书只要是国家承认的大学本科毕业证书，考生可以考研。
研究生招生简章中规定，报名参加全国硕士研究生招生考试的人员，考生的学历必须符合下列条件之一即可报考研究生：
1.国家承认学历的应届本科毕业生；
2.具有国家承认的大学本科毕业学历的人员；
3.获得国家承认的高职高专毕业学历后满2年或2年以上，达到与大学本科毕业生同等学历，且符合招生单位根据本单位的培养目标对考生提出的具体业务要求的人员；
4.国家承认学历的本科结业生和成人高校，含普通高校举办的成人高等学历教育，应届本科毕业生，按本科毕业生同等学历身份报考；
5.已获硕士、博士学位的人员，在校研究生报考须在报名前征得所在培养单位同意。