可以，只要你是经门诊医生开具了检查单，核磁共振项目属于医保报销的范畴，不管是门诊还是住院都能报销，只不过报销的比例是不一样的。
医院门诊做核磁共振是不可以报销的。门诊各种检查和化验都是自费的，只有办理了住院手续后各种化验和检查（包括核磁共振）才可以按規定比例报销。
不报销
门诊行胃镜检查是不报销的,只有住院以后行胃镜检查才能报销,进行胃镜检查,为了清楚的看到消化道的粘膜、必须使被检查部位很干净,即没有食物也无血块残存。