1.初始化模块：科目设置、期初余额录入、外币、凭证类别、结算方式等。
2.凭证输入模块：凭证录入、审核录入、审核、凭证汇总、凭证输出。
3.登账、结账模块即期末处理模块。
4.行对账模块。
5.证账输出模块。
计算机账务处理系统简化了会计循环，消除了手工会计信息处理的许多技术环节，对会计人员的技术要求只在于从原始凭证到记账凭证的编制和确认；记账凭证是数据处理的起点。
手工账务一般是从处理原始凭证开始，而计算机账务系统一般不直接处理原始凭证，无论采用前台或后台工作方式，一般都需要由人工编制记账凭证输入系统，并以此为起点开始数据处理；部分凭证可以由机器自动生成。
手工系统中所有的记账凭证都要人工制作，而计算机账务系统中的部分记账凭证可以由系统自动生成，实现所谓的自动转账。
账务处理系统内部对于待摊、预提、摊销、损益结转等每月固定的转账凭证可由机器自动生成；电算化系统中的其他子系统都可以自动生成记账凭证并传递给账务处理系统；由电子商务产生的电子凭证也可以自动转换为记账凭证，并传给账务处理。
1.主要表现：账务处理模块与其他模块之间的联系主要表现为记账凭证数据的传递；
2.原因：账务处理子系统以会计凭证为数据处理对象，而会计凭证包含的会计信息相对比较全面、标准，因此账务处理子系统与其他子系统之间的联系也主要表现为凭证数据的传递；
3.分析：账务处理模块是购买了财务软件之后的必备模块，也是处理所有财务数据的核心，其本身可以不借助于其他模块的支撑而独立进行所有账务处理。
只不过对数据处理的广度和深度，不如拥有其他模块相互协作的效用明显而已，对财务的数据的梳理和分析亦弱于其他模块的相互配合与协同。