显微镜的每个镜头都是要保养的，显微镜放置的房间一般要保持干燥，干净。
并且要用罩住，防止灰尘。
一般的生物学观察显微镜的油镜上面是“x100”，为最后一个镜头，较少用到。
用完之后要用二甲苯洗掉油。
用檫镜纸檫干净。
油镜头在用之前，需用香柏油来提高折射率从而提高成像的清晰度，具体做法是在显微标本的盖玻片上滴上香柏油，然后油镜头进入光路并与油充分接触，中间不能有汽泡，通过显微镜的微调获得清晰的成像。
使用完毕后，需要先用擦镜纸把镜头前端表面玻璃上的油擦去，再用镜头纸醮专用清洁液（可用无水乙醇和无水乙醚按1比4混合）来再次擦试镜头前端表面的玻璃。
擦试时，只能从一个方向往另一个方向擦试，不可来回擦试。
显微镜不用时，需要用防尘罩给罩上，以防灰尘污染显微镜的光路及镜头玻璃表面。
显微镜最重要的组成部分如下：
1.主要的部件是目镜和物镜，其他的结构可以分为光学系统和机械系统；
2.外光源显微镜由光学部分和机械部分组成，内光源显微镜由光学部分，机械部分和电路部分组成；
3.显微镜是一种精密的光学仪器，已有300多年的发展史，自从有了显微镜，人们看到了过去看不到的许多微小生物和构成生物的基本单元，细胞；
4.显微镜不仅有能放大千余倍的光学显微镜，而且有放大几十万倍的电子显微镜，使我们对生物体的生命活动规律有了更进一步的认识。
1.显微镜焦距很小，通过物镜成放大、倒立、实像，这样物体必须放在物镜的一、二倍焦距之间，所以物镜焦距要小；
2.显微镜焦距很小，通过目镜成放大、正立、虚像，这样物体必须放在目镜的一倍焦距以内，所以目镜焦距要大。