基因表达谱测序是DNA水平测序,是直接对某一物种或特定细胞在某一功能状态下产生的mRNA进行高通量测序,可以用来研究基因的表达差异情况。
该技术结合了转录组测序建库的实验方法,与转录组测序相比,基因表达谱测序要求的读长更短,测序通量更小,但仅可用于基因表达差异的研究。
转录组测序是RNA水平测序,相当于DNA水平的基因组测序,是一个框架。
表达谱主要研究的是基因表达量的变化,上调或下降。
先要有转录组或是基因组才可以做表达谱,否则没有Ref做参考。
转录组测序和表达谱测序其实都是通过高通量测序技术进行的,转录组测序主要是针对没有参考基因组(即基因组未完成测序)的物种,侧重于获得你材料的全部转录组信息,而表达谱则侧重于检测各个基因的表达量。
亲子鉴的作用是判断有争议的父母、子女之间是否有亲子关系,通过DNA检测分析做亲子鉴定的原理是盂德尔的遗传规律。
DNA存在于细胞核内的染色体上,人类为维持种族的延续,必须把他们的遗传信息稳定地传递给下一代,夫妻之间各自提供的23条染色体,在受精后相互配对,构成了23对孩子的染色体,如此循环往复构成生命的延续。
尽管遗传多态性的存在,但每一个人的染色体必然也只能来自其父母,这就是DNA亲子鉴定的理论基础。
DNA甲基化能引起染色质结构、DNA构象、DNA稳定性及DNA与蛋白质相互作用方式的改变,从而控制基因表达。
DNA甲基化通常抑制基因表达,去甲基化则诱导了基因重新活化和表达。
这种DNA修饰方式在不改变基因序列的前提下实现对基因表达的调控。
真核生物中DNA甲基化一般发生在CpG位点上;哺乳动物DNA甲基化只发生在CpG岛的胞嘧啶;植物甲基化发生在CpG和CpNpG。
甲基化会使胞嘧啶转为甲基胞嘧啶,CpG位点的甲基化可以对基因表现有重要的影响。
哺乳动物中CpG序列在基因组中出现的频率仅有百分之一,远低于其它双核苷酸序列。
但在基因组的某些区域中CpG序列密度很高,称这些区域为CpG岛。
通常CpG岛大约含有500多个碱基,位于基因的启动子区或第一个外显子区。
在哺乳动物基因组中约有4万个CpG岛,而且只有CpG岛的胞嘧啶能够被甲基化。