孵化器的盈利模式主要有5种模式：一、租金类收入：租金类收入往大里面说是物业性收入，包括房租、物业管理费以及少量出售型物业等等，是孵化器最初级的收入方式，孵化器盈利模式中“现在模式”典型的代表，也是我国大部分孵化机构的主要收入方式之一；二、服务类收入：园区内建立各种收费性的服务机构，依靠为园区企业提供综合型的商务服务外包服务赚取服务费用。

这也是孵化机构在完善孵化器服务体系中产生的一种盈利模式。

这种盈利模式从本质上来说也是属于“现代模式”的代表特别是随着孵化规模的扩大，入孵企业增加，企业所需要的商务外包服务的总规模需求相应的就会越大；三、政府补贴：政府补贴是我国孵化机构弥补经营亏损的主要方式。

政府补贴模式分两种：一种是成本性补贴，一种是收益性补贴；成本性补贴主要是指政府对孵化机构进行扶持，在一定期限内免征房产税、土地使用税、营业税和所得税等税收成本，并且可以返还孵化机构购买土地的部分土地出让金。

通过政府税费上的优惠，降低孵化机构的运营成本；收益性补贴则是通过政府奖励、税收分成等模式，与政府分享孵化机构内企业发展的成果。

但国内大多地方政府会给孵化机构类似“三免两减半”等税收政策优惠，因此本来在工业地产上最为可观的收入模式，在孵化机构中也会大打折扣；四、股权收益：股权收益就是孵化机构通过各种渠道方式分享入孵企业一定比例的股权，在企业毕业后，通过资本运作，出售所占有的股权实现资产增值。

而孵化机构分享入孵企业的股权形式是多样化的。

最简单的就是直接投资。

通过直接投资将孵化机构与在孵企业的利益加以连接；五、投资收益：该模式与股权收益的不同之处在于，股权投资是对企业进行投资，分享企业未来的发展潜力。

而投资收益则专注于对在孵企业的创新性产品进行投资。

实质上就是孵化机构参与到一个具体项目的运作中，通过对在研制阶段的产品或技术进行投资，分享产品或技术研制成功，市场化之后的利润。