对于违规进出口的情况，海关将根据具体情况对进出口人给予处罚。
处罚包括罚款及没收货物。
海关是依据本国或地区的法律、行政法规实行进出口监督管理职权的国家行政机关。
但是由于各国政治、经济情况不尽相同，海关职责也有差异，即使同一国家的海关，各个历史时期海关职责也有变化。
但以下几项职责是绝大多数国家海关基本相同的：对进出口货物、旅客行李和邮递物品、进出境运输工具，实施监督管理，有的称作通关管理，有的称作保障货物、物品合法进出境；征收关税和其他税费；查缉走私等。
一、税务机关通过稽核系统将纳税人申请稽核的海关缴款书数据，按日与进口增值税入库数据进行稽核比对，每个月为一个稽核期。
海关缴款书开具当月申请稽核的，稽核期为申请稽核的当月、次月及第三个月。
海关缴款书开具次月申请稽核的，稽核期为申请稽核的当月及次月。
海关缴款书开具次月以后申请稽核的，稽核期为申请稽核的当月。
二、稽核比对结果分为相符、不符、滞留、缺联、重号五种。