根据人事部、国家食品药品监督管理总局颁布了《执业药师资格制度暂行规定》规定，本科生物工程专业如果有药学内容，毕业可以报考执业药师，同时还需要从事药学或中药学专业工作满3年才可以。
执业药师资格报考条件：凡中华人民共和国公民和获准在我国境内就业的其他国籍的人员，遵纪守法并具备以下条件之一者，均可参加执业药师资格考试：
1.取得药学、中药学或相关专业中专学历，从事药学或中药学专业工作满7年；
2.取得药学、中药学或相关专业大专学历，从事药学或中药学专业工作满5年；
3.取得药学、中药学或相关专业大学本科学历，从事药学或中药学专业工作满3年；
4.取得药学、中药学或相关专业第二学士学位、研究生班毕业或取得硕士学位，从事药学或中药学专业工作满1年；
5.取得药学、中药学或相关专业博士学位。
全国执业药师资格考试简介：全国执业药师资格考试由国家人事部、国家食品药品监督管理局共同负责执业药师资格考试工作。
执业药师是负责提供药物知识及药事服务的专业人员。
执业药师是药物的专家，同时是解答市民大众有关药物问题的最适当人选。
适宜于医药、食品、环保、商检等部门中生物产品 的技术开发、工程设计、生产管理及产品性能检测分析等工作及教学部门的研究与教学工作。
本科生直接从事科研方面工作的可能性不大，部分毕业生转向其它行业，部分毕业生从事相关专业的下游技术工作。
毕业直接在医药，食品等方向就业，工作内容一般较单调的技术工作，且需要进一步的经验积累和实践操作能力，培养未来雇主。
生物工程专业的学生毕业后能去的单位有：
1.省、市、自治区各级疾病预防控制中心、卫生监督所，从事卫生理化检验、微生物检验和毒理学评价工作。
2.海关及省、市进出口检验检疫局的相关检验科室，从事进出口产品理化检验和微生物检验工作。
3.医院检验科及营养科，从事生物材料检验与食品的生化、病毒和细菌学检验。
4.各级自来水公司，从事水质理化和微生物检验。
5.各级环境监测站，从事水质、土壤、空气等环境样品的检测工作。
6.各类食品厂、化妆品厂等企业的产品检验科，从事食品和化妆品产品质量检验。
7.技术监督局、药检所从事检验工作。