鱼缸里生水藻，有几种应对方法：1、加盐。
加盐可以阻止水藻生长。
2、遮光。
无论是灯光还是太阳光都会促进水藻生长，尽量削减灯光照明时间，避开太阳光的照射。
3、引进食藻生物。
像青苔鼠、虾以及玛丽之类的热带鱼都会摄食水藻。
黑壳虾除藻功能普通，推荐使用於草缸处理腐败之叶片，对於小细缝及叶片上的藻类有意想不到的功能，能在水族箱中繁衍，但有带菌的问题。
大和藻虾除藻功能与黑壳虾差不多，体型较黑壳虾大。
虽然螺类也吃水藻，但不建议引进，因为容易失控。
4、手动清楚。
缸壁上直接刷掉，加清水剂打掉水中浮游的水藻。
5、用除藻剂。
使用除藻剂，效果普通，优点是对任何藻类都有效，且可有效清除附著在水草、沉木等不易清除地方的藻类。
缺点是依据品质不同对鱼和生态平衡有一定程度的冲击。
鱼缸里的小虫以蛋白虫居多，蛋白虫属线虫的一种，体长1毫米至1厘米不等，白色，寄生于滤材缸壁或鱼体上，繁殖速度极快且很难清除。
蛋白虫的危害极大。
当虫体粘附于如罗汉鱼体一类鱼身上时会造成痒痛等不适，轻者造成罗汉蹭缸，重者造成罗汉突然撞缸、厌食、缩头、绺鳍等。
尤其是粘附于罗汉鱼腮上时危害更大，所以产生了蛋白虫一定要及时清除。
一般使用肠虫清类药物，该类药物通过阻止蛋白虫对葡萄糖等养份的吸收，使虫体耗光能量枯竭体能至死，对虫卵同样具体抑制和杀灭作用。
适量食用对鱼基本没有损害。
80-100cm缸一次两片，放在过滤出水口让水将药自然分解，使蛋白虫停食、断氧，约十分钟后即可显效，会看到鱼缸壁上有虫体脱落，下药24小时后基本可清除蛋白虫，换水三分之一或二分之一，次日再换水三分之一，以后逐渐适量换水稀试。
可从根本上彻底清除蛋白虫，且不损害硝化菌。
鱼缸中最常出现的藻类有三类：蓝藻、绿藻和黄绿藻。
绿藻是淡水水族缸中最常见的藻类，而且种类极多。
其及为耐阴，只要有一点光线即能生存。
目前尚无一种完美的方法去除水藻，仍然是“预防为主，治疗其次，综合运用”为主要。
预防水藻的方法：鱼缸不要让阳光直射。
控制鱼只蜜度，适当减少鱼的数量。
减少鱼饵的投放量。
勤换水，但一次换水量不宜过多。
将附在缸壁上的污垢及时清理掉。
加强鱼缸的过滤系统，使之更有效率。