主题思想是以记叙藤野先生为中心内容，以作者的爱国主义思想感情为内在线索，通过直接描写和间接表现、正面记叙与反面衬托，深情地赞颂了藤野先生正直高尚的思想品德、严肃认真的科学态度和一丝不苟的工作作风，特别是为学术、为中国的伟大精神，以及他对作者自己的深刻影响。
《藤野先生》是鲁迅的一篇回忆散文，记叙了作者从东京到仙台学医的几个生活片断。
其中有东京清国留学生的生活情况，由东京到仙台的旅途回忆，有在仙台的食住情况，也有受到日本具有狭隘民族观念的学生的排斥，还有一次看电影受到的刺激，而重点却是记叙藤野先生的可贵品质。
藤野先生本名藤野严九郎，是作者的老师。
1902年，他东渡日本，开始在东京弘文学院补习日语，后来进入仙台医学专门学校。
他之选择学医，意在救治像他父亲那样被庸医所害的病人，改善被讥为“东亚病夫”的中国人的健康状况。
在日本，作为一个弱国子民的鲁迅，经常受到具有军国主义倾向的日本人的歧视。
在他们的眼睛里，凡是中国人都是“低能儿”，鲁迅的解剖学成绩是59分，就被他们怀疑为担任解剖课的教师藤野严九郎把考题泄露给了他。
这使鲁迅深感作为一个弱国子民的悲哀。
他认识到，精神上的麻木比身体上的虚弱更加可怕。
要改变中华民族在强国林立的现代世界上的悲剧命运，首要的是改变中国人的精神，而善于改变中国人的精神的，则首先是文学和艺术。
于是鲁迅弃医从文，离开仙台医学专门学校，回到东京，翻译外国文学作品，筹办文学杂志，发表文章，从事文学活动鲁迅把个人的人生体验同整个中华民族的命运联系起来，奠定了他后来作为一个文学家、思想家的基本思想基础他。
1.写藤野先生检查并从头到末地修改“我”抄的讲义。
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2.写藤野先生指出“我”绘的解剖图中的错误。
表现了先生热情关心，严格要求的工作作风。
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3.写藤野先生为“我”不信鬼神，敢于解剖尸体而感到高兴和放心。
表现了先生的正直无私，直挚诚恳的工作精神。
4.写先生向“我”询问，了解中国女人裹脚的情形。
表现了先生的探索研究，实事求是的精神。
nbsp;这四件事，(1)(2)两件是详写，(3)(4)两件是略写。
通过这四个典型事例的记叙，赞颂了藤野先生认真负责、从严治学、热情关怀、正直诚恳、毫无民族偏见的高尚品质。
这些也就是藤野先生为什么要满腔热情地教育鲁迅的原因。