酶是一种特殊的蛋白质，在分离纯化过程中需要注意温度以及PH值等的控制，注意在纯化过程中所使用的缓冲溶液的离子强度的控制，常用PBS缓冲溶液，在实际纯化过程中，一般要在低温冰箱中进行，缓冲溶液中注意加入EDTA二钠盐、螯和重金属离子一般避免酶失活。
常用分离步骤包括分子筛层析、离子交换、疏水层析等步骤。
酶的分类如下：
1.与DNA复制有关的酶。
2.与DNA转录有关的酶。
3.与蛋白质翻译有关的酶。
4.与逆转录有关的酶。
5.与基因工程有关的酶。
6.与植物细胞工程有关的酶。
7.与动物细胞工程有关的酶。
8.组成酶类。
9.诱导酶类等。