1.广东海洋大学是一所国家公办大学，单位性质是事业单位。
广东海洋大学寸金学院则是一所民办学校，单位的性质是民办非企业；
2.职工身份不同。
广东海洋大学的教职工，其身份是事业单位职工，拥有事业单位编制。
广东海洋大学寸金学院的职工不享有事业单位编制；
3.办学水平不同。
广东海洋大学无论在师资水平、科研水平、教学资源上，均远超广东海洋大学寸金学院。
尤其是在科研方面，广东海洋大学每年均进行大量不同层次的科研工作、科研立项；
4.经费来源不同。
广东海洋大学的主要经费来源是财政拨款，学费占经费支出的比例很少。
而广东海洋大学寸金学院的经费来源，几乎均来自学费收入。
两个大学各有千秋。
广东海洋大学，原名湛江海洋大学，是广东省重点建设大学，以海洋和水产学科为特色，理、工、农、文、经、管、法、教等学科协调发展，以应用学科见长的多科性海洋大学。
学校的前身是成立于1935年的广东省立高级水产职业学校，是广东现代海洋水产教育的发端，至今已有74年的办学历史，培养了10万多名应用型高级专门人才，成为促进广东经济社会发展和南海资源开发利用的重要力量。
岭南师范学院，原名湛江师范学院，是一所集“全国精神文明建设工作先进单位”、“全国群众体育工作先进单位”、“全国绿化先进集体”、“教育部依法治校示范校”和“教育部大学英语教学改革示范校”等称号的一所具有百年师范教育历史的广东省属本科院校。
两所学校各有所长。
广东海洋大学是广东省人民政府和国家海洋局共建的省属重点建设大学，是一所以海洋、水产、食品学科为特色，理、工、农、文、经、管、法、教、艺等学科协调发展，以应用学科为主体的多科性海洋大学，具有"学士、硕士、博士"完整学位授权体系。
东莞理工学院是广东东莞的第一所普通本科院校，省市共建，以市为主，由诺贝尔物理学奖获得者杨振宁博士任名誉校长。
学校筹办于1990年，1991年国家教委批准先行招生；1992年经国家教育部批准正式开学，招收专科生；2002年获的教育部提批准，招收本科生；2005年开始与华南理工大学、暨南大学联合培养研究生，并进行招生；2006年获得颁发学士学位资格；2007年，东莞理工学院具备招收港澳生资格；2010年学校停招专科生，同年8月获批成为广东省立项建设的新增硕士学位授予单位。