外表看似小孩，其真实身份是高中生侦探工藤新一，和青梅竹马的同学毛利兰一起去游乐园玩，目击到黑衣男子的可疑交易现场，被灌下开发中的药物，变成了小学生的身体。
那天以后，为了隐藏真实身份，化名江户川柯南，在青梅竹马的毛利兰家寄住的同时，日复一日解决了许多案件。
一切都是为了恢复自己的身体。
2014年起，作品在读卖电视台和日本电视台播出时，字幕形式做出了更改。
通过电话的声音会以“电话符号”标注，柯南使用领结型变声器时会出现“蝴蝶结符号”，而使用少年侦探团成员的有着内置对讲机的徽章时，会以“侦探团徽章符号”表示。
1.《柯南同人之毛利雨》，作者是黑羽樱子。
2.《穿越柯南之白樱凌》，作者是甜心韵。
4.《名侦探柯南之无敌存在》，作者是无爱的PM。
5.《名侦探柯南之小羽》，作者是龙翎曜。
6.《柯南之月之哀伤》，作者是红尘妖恋。
7.《柯南之修罗明月》，作者是糊涂小思。
8.《柯南同人之迷茫》，作者是白色悬念。
9.《柯南之蓝羽》，作者是落叶流殇。
10.《柯南之不一样的兄弟》，作者是不一样的K。
1.《名侦探世界里的巫师》，作者是追梦人Love平。
2. 《红楼名侦探》，作者是嗷世巅锋。
3. 《韩娱之名侦探》，作者是有鱼的天空。
4. 《超级侦探先生》，作者是影山红。
5. 《名侦探柯南之移动炸弹》，作者是能飞的马。
6. 《星际侦探社》，作者是?龙四哥。
7. 《柯南之我的侦探系统》，作者是武家大狼。
8. 《国民大侦探》，作者是牛头道长。
9. 《名侦探柯南之咖啡店主》，作者是杨小林。
10. 《进击在名侦探柯南》，作者是妖族太一。