1.涵盖的内容不同。
违反交通指示信号灯包含内容较广，例如左转信号灯没有变绿时左转、右转灯没有变绿时右转都属于违反交通指示信号灯通行。
闯红灯内容只有一项，即为红灯亮时还在通过路口向前行驶。
2.处罚力度不同。
根据《机动车驾驶证申领和使用管理规定》闯红灯一次要扣六分，罚款二百元。
其他违反信号灯通行情况，扣两分，罚款一百元。
交通信号灯由红灯、绿灯、黄灯组成。
红灯表示禁止通行，绿灯表示准许通行，黄灯表示警示。
红灯亮，禁止直行或左转弯，在不碍行人和车辆情况下，允许车辆右转弯；绿灯亮，准许车辆直行或转弯；黄灯亮，停在路口停止线或人行横道线以内，已经继续通行；黄灯闪烁时，警告车辆注意安全。
根据2013年公安部颁布的新交规，驾驶机动车违反交通信号灯规定闯红灯的，记6分，罚款200元。