参保范围不同：城镇职工医疗保险的参保范围是城镇用人单位及其职工和参加了基本养老保险的灵活就业人员；城镇居民医疗保险的参保范围是不属于城镇职工基本医疗保险制度覆盖范围的所有城镇居民。
缴费标准不同：在职职工按本人工资总额的百分之2缴纳，用人单位按在职职工工资总额的百分之
7.5缴纳。
退休人员本人不缴费，原用人单位按退休人员退休金总额的百分之5缴纳。
灵活就业人员由本人按上年度全市在岗职工平均工资的百分之8缴纳。
缴费年限不同：城镇职工医保退休后个人不在缴费，但灵活就业人员的最低缴费年限为15年，退休时不够15年的要一次性补够15年，才能享受退休职工医疗待遇。
城镇居民医保终生缴费，才能终生享受。
医疗待遇不同：按今年的标准，统筹年度内的基本医疗保险最高支付限额分别为城镇职工7万元、城镇居民3万元。
二者各有优势。
1.新农合，缴费少，待遇当然也要低一些；居民医保，缴费比新农合高，待遇当然也要高。
2.居民医保2018年新增高血压、类风湿性关节炎、冠心病等6种门诊管理病种，俗称门诊慢病。
新农合没有此类门诊慢病。
就医人员住院时必须向参保地医保中心申报备案，如果不按规定办理报备手续，住院发生的医疗费用医保机构不予报销。
根据城镇居民医疗保险政策规定，参保人在异地就医须事先到参保地医保经办机构登记，备案，其医药费先由个人全额垫付。
出院后一个月内，凭户口簿、患者身份证复印件、居民医保证、医药费发票及明细清单、出院证、异地居住证明或暂住证等资料到户籍所在地医保经办机构办理医疗费用报销手续。