根据工厂的用工规定决定。
行政拘留只是一种行政处罚，不是刑事处罚。如果被拘留人原来是在正规厂里工作的，拘留结束后，可以继续回原单位上班。如果被拘留人在拘留前没有在工厂上班，拘留后想到正规厂子去上班，应当在厂子招工时，去应聘，如果招聘条件上接受过行政拘留的人，那他通过应聘后，可以去上班。如果招聘厂子不接受受过行政拘留的人，那他就进不了这家工厂上班。
拘留48小时是否会留案底，取决于具体情况。
如果只是因为违法被拘留48小时，例如扰乱公共秩序等，这种情况下会有违法记录，但不会有案底。违法记录虽然会被留存，但一般情况下非司法机关是不可以随意查询的，而且不会对当事人今后入学、招工、公务员考试等方面产生影响。
如果拘留48小时是因为涉嫌犯罪，例如刑事案件等，那么会在公安部门留有案底。而且，一旦被人民法院依法审判并判处有罪，犯罪记录将会影响当事人今后的入学、招工、公务员考试等方面。
因此，拘留48小时是否会留案底，需要具体情况具体分析。
行政拘留过可以进厂工作的，一般不会受到影响，因为被行政拘留一般只是违法而不是构成犯罪。行政拘留是公安机关依法对违反行政管理秩序的公民采取限制其人身自由的惩罚措施，一般对被决定给予行政拘留处罚的人，是由作出决定的公安机关送达拘留所执行。按照目前的规定和政策，一般只要不是刑事案件或者信用征信有问题的，则不会对公务员以及国企的录用造成影响。