张家口左卫和右卫的主要区别在于地理位置和历史背景。左卫镇位于河北省张家口市怀安县的东北部，是该县的一个镇级行政区划。而右卫城则位于张家口市万全区的万全镇，是一座有着600多年历史的古城，被誉为“京西第一卫”和明代卫所制的“活化石”。

此外，左卫镇和右卫城在功能定位上也有所不同。左卫镇是一个现代化的行政区划，拥有工业企业、商业设施等，居民生活较为便利。而右卫城则是一座保存完好的古城，其城内功能分区以东西、南北大街为界，不同区域分别承担着不同的功能，如文化教育区、行政办公区、仓储区和生活居住区等。

综上所述，张家口左卫和右卫在地理位置、历史背景和功能定位等方面均存在显著的差异。