衢州马拉松的全程马拉松赛道长度为42.195公里。比赛从衢州市文化艺术中心和便民服务中心出发，穿越南孔古城，沿着衢江展现衢州的自然景观和人文历史，赛道还融入了杭州第19届亚运会火炬传递衢州站的部分路线<span class='newsIndex item-undefined-1'>1</span>。