莫斯科国立大学数学系使用的学习软件有俄罗斯莫斯科国立大学预科部所使用的在线学习平台、课堂互动软件如Zoom、Google Meet以及数学软件MATLAB、绘图软件Autodesk等。这些软件工具帮助学生查阅课程资料、完成作业、参与讨论以及进行学科实践操作。