自制的红糖馅如果是短期内（几天内）会用完的话，可以放在冷藏室中保存。但如果不打算短期内使用，建议将其放在冷冻室中冷冻保存。冷冻可以有效延长其保质期，防止馅料变质或失水干燥。

在放入冷冻室前，建议按照一次使用的量将红糖馅分装到小袋子或者密封容器中，这样方便取用，也减少因为反复解冻而导致的品质下降。使用时取出所需分量，剩余的继续冷冻保存。

记得在包装上写上日期，以便跟踪保存的时间，管理食品的安全。