如果员工在工作中发生了工伤，导致企业需要变更营业执照，首先应该及时上报新的情况并申请办理营业执照的变更手续。需要提供相关的申请材料，并跟进审批进度。同时，企业还需要根据工伤保险相关规定，为工伤员工提供相应的医疗救治和补偿。
工伤后保险基金会赔偿包括医疗费、伤残津贴、康复费、丧葬费等。医疗费用包括治疗费、住院费、手术费等；伤残津贴根据伤残程度给予一次性或定期支付；康复费用用于康复治疗和辅助器具；丧葬费用用于工伤职工的丧葬事宜。此外，还有一次性伤残补助金、生活护理费等其他补偿项目。具体赔偿标准和金额根据不同地区和政策规定有所不同。