用真空食品袋包装的食品灭菌，一般不使用高压灭菌,因为高压灭菌温度过高，会使包装袋变质。

现在一般使用巴士灭菌法，就是在水温70至90度之间，将灭菌袋保温30至60分钟，具体根据物体的大小和其他情况去定，可以事先查一下所需要灭菌的物体的具体数据。

脉动真空灭菌器主要用于对空腔物品及器具等进行蒸汽灭菌。

在制药行业中可对瓶塞、操作工具、大量的工作服等不需降温防爆的布类物品或药品进行灭菌，也可用于制药行业中生产卫生材料、敷料、器械等产品的单位作灭菌设备，可用于药材的灭菌、熏蒸和烘干。

也可用于食品灭菌。

密封门设有电气和机械压力安全连锁装置，当灭菌室内有压力时密封门不能被打开，确保设备及操作者人身安全。